Un track no tiene waypoints. Supongo que a lo que te refieres es a saber si puedes generar tantos waypoints como puntos tenga el track, ¿no?...
Pues sí, si que tienes forma... muy variadas según tus preferencias...
1º) Si tu track tiene muchos puntos y tan sólo querrías un esbozo del mismo, tan simple como convertir tu track a ruta, darle un número de puntos que quieras generar como waypoints intermedios y una vez tengas la ruta, arrastras esta en el árbol de datos a waypoints y ya los tienes...
2º) Si quieres tooooodos los puntos del track, entonces lo más simple es que exportes el track como csv y luego importes los waypoints desde dicho csv
Respecto a guardar tu track para abrirlo en arcgis, tan simple como guardar el track como y guardarlo en formato shape (shp), perfectamente entendible, como sabrás, por ArcGis/ArcMap.
Un saludo...
Todo el día de arriba para abajo...